1、每次使用儀器都要對篩孔進行清洗和消毒。清洗時使用清潔劑和溫水即可。通過在熱流水下固定篩孔層或是把它們浸入幹淨的水中或浸入到超聲波清洗器裏的淨水中均可以除去肥皂。在氣泵孔裏的篩孔層應該用工具進行檢查。如果這些孔被堵住或部分孔被堵住的話，在清洗它們時有效的方法就是使用幹燥器或是便捷式氟利昂火器的氣泵震動。在使用之前，先用70%丙三醇擦拭網墊。
2、放置培養基。
3、用三抓彈簧固定鉤固定。
4、矽膠軟管連接采樣器與控製器。
5、打開電源開關。
6、設置定時采樣方法。按Time鍵，液晶閃爍狀態顯示000，按▲鍵設置所需定時的時間，且在1-999分鍾範圍內可調。
7、設置采樣時間地方法。連續按Time鍵，直到液晶閃爍狀態顯示0.0.0，按▲鍵調整所需要的時間。再次按下Time鍵液晶不再閃爍，且顯示數值為時間，如001。
8、設置采樣流量方法。按流量調整鍵▲選擇分鍾流量數值。按Stop/start鍵開始采樣或定時采樣，采樣完成後自動停機並出現提示音。
空氣微生物采樣器現場采樣方式
將三角架支開並鎖緊，把三角架頂部調至水平，主機放在三角架上，撞擊器放在桌上或地上，用橡膠管連接撞擊器出氣口→主機進氣口。
順序放入采樣平皿，一手打開平皿蓋，另一手迅速蓋上撞擊盤，然後按住定時器上部，掛上三個彈簧掛鉤。放入和取出采樣平皿時，必須戴口罩，以防口鼻排除細菌汙染平皿。
打開撞擊器進氣口上蓋，離開采樣點2米之外，即可啟動采樣。可用定時器設定采樣時間，參照定時器使用說明書。
采樣時間長短視所才空氣環境的汙染程度而定，但追好不超過30分鍾，而長時間的氣流衝擊致使采樣介質脫水而影響微生物生長。
為了保持菌落計數的準確性，每個平皿的均落在250個以下為宜，一般室外空氣環境采10分鍾，室內空氣環境采1-5分鍾即可。
采樣完畢後，取出采樣平皿扣上蓋子，注意順序和編號號碼，切勿弄錯。
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